Molekularna destilacijaje posebna tehnologija razdvajanja tekućina-tečnost, koja se razlikuje od tradicionalne destilacije koja se oslanja na princip razdvajanja razlike u tački ključanja.Ovo je proces destilacije i pročišćavanja materijala osjetljivog na toplinu ili materijala visoke točke ključanja koristeći razliku u slobodnom putu molekularnog kretanja pod visokim vakuumom.Uglavnom se koristi u kemijskoj, farmaceutskoj, petrokemijskoj, začini, plastici i nafti i drugim industrijskim poljima.
Materijal se prenosi iz posude za napajanje u glavni isparivač sa omotačem za destilaciju.Kroz rotaciju rotora i kontinuirano zagrijavanje, materijalna tekućina se struže u izuzetno tanak, turbulentan tekući film i gura prema dolje u obliku spirale.U procesu spuštanja, lakši materijal (sa niskom tačkom ključanja) u materijalnoj tečnosti počinje da isparava, prelazi u unutrašnji kondenzator i postaje tečnost koja teče dole u bocu za prijem lake faze.Teži materijali (kao što su hlorofil, soli, šećeri, vosak, itd.) ne isparavaju, već teče duž unutrašnjeg zida glavnog isparivača u bocu za prijem teške faze.